El Profesor de Horticultura, el Dr. Terou Higa, llevó a cabo en los años 70 en la Universidad de Ryukyus en Okinawa (Japón) la investigación con cultivos microbianos para mejorar el crecimiento de las plantas. Su investigación se ocupó principalmente de los cultivos microbianos que se usan en la producción de alimentos de ácido láctico. Así que se encontró, por casualidad, una combinación de microbios que son capaces de influir en la descomposición de materia orgánica (hostil) de modo que se conviertan en procesos que mejoran la vida (bacterias ácido lácticas, bacterias de levadura, bacterias fotosintéticas y hongos).
El llamó a esta combinación de cepas microbianas EM, «Microorganismos Eficaces».Un hallazgo importante de su investigación era que podía dividir a todos los microbios existentes en tres grupos, sus efectos se explican por el principio de dominancia. Estos tres grupos son: